航行新技术研究所在科学研究和技术支持方面取得优异成绩，承担并完成了包括国家863项目、国家973项目、国家自然基金项目、国家空管委项目和民航局项目等多项课题，共获部级科技成果10项，申请国家专利3项，获得软件著作权1项。

PBN技术打破国外垄断，树立民族品牌。2013年至今创造多个第一次，第一次开发出自主知识产权的PBN程序设计和验证平台；第一次打破了国外RNP APCH程序服务提供商在该领域的垄断地位；第一次打破了中国民航在RNP AR领域零的突破；第一次自主全程帮助航空公司建立RNP AR能力并完成的RNP AR飞行程序，打破了波音、GE等国外程序商的强势垄断地位；第一次独立自主完成设计RNP AR公共程序；第一次取得了ICAO颁发的PBN飞行程序设计纸质。

航行所是北斗技术向民航业转移和产业化的重要枢纽。2017年1月1日，经中国卫星导航定位应用管理中心批准，获得民航行业首家"北斗导航民用分理级服务试验单位资质"。此外，航科院也获得了民航局批复"代表民航局负责民航行业北斗卫星无线电测定业务授权"。

成功突破了导航数据编码和校验突破关键技术。航行所目前为国内多家航空公司提供导航数据校验服务，包括：国航、南航、东航、深航、上航、川航等26家公司，总计校验数据库的数量为50余个，成为国内该领域最大的服务商。

积极推动航班时刻研究和机场容量评估。航行所在此领域的技术研究已达到国内领先国际先进水平，在行业管理决策支持过程中有着重要作用。先后为行业政府完成航班时刻研究项目；此外，还为二十余个大型繁忙运输机场的扩容增量完成了艰巨的容量评估，支撑行业健康有序地发展。