安检航站楼地下一层是个广场式的换乘中心，可以换乘高铁、地铁、城铁等，京雄城际铁路与城际联络线、大兴机场线三条线路将共同使用这一换乘中心，换乘通廊可以实现相互换乘。据北京大兴国际机场管理中心公共区管理部运输服务主管牛全伟介绍，民航、铁路、轨道三个系统经过多轮磋商，制定了协调、一致、连续、标准化的标识语言，并设有大屏的动态信息指示板为旅客指引换乘方向。

大兴机场将轨道站台、公交枢纽与航站楼进行了一体化设计，轨道交通在机场航站楼正下方穿越，站台位于航站楼地下一层（京雄城际铁路、城际铁路联络线站台与航站楼间步行距离150米。新机场快线、地铁R4线、北京－河北预留线站台与航站楼间步行距离75米）。